校準是所有儀器系統的基礎步驟。其目的是使測量過程中的偏差最小化。優良實驗室規范（GLP）要求確效步驟以確認在校準過程中沒有引入偏差。校準確效具有兩個明顯的功能： 1）測量校準步驟的準確度；或2）指示校準偏差。

在有效校準之后即刻進行準確度確效，以提供校準曲線準確度的簡單度量。用于確效準確度的標樣，不應使用校準用標樣，應單獨配制，或使用不同的化合物。這種情況下，確效標樣起到完全獨立的toc總有機碳分析儀校準對照標樣的作用。與之不同，如果在遲些時候（例如校準后六個月）進行確效，其主要目的是提供校準偏差的指示。用于確效校準偏差的標樣應該與校準時使用的標樣濃度相同。

先把水中有機物的碳氧化成二氧化碳，消除干擾因素后由二氧化碳檢測器測定，再由數據處理把二氧化碳氣體含量轉換成水中有機物的濃度。經過不斷的研究實驗，TOC檢測方法從傳統的復雜技術漸漸變成便捷準確。

該方法是在氧化之前經磷酸處理待測樣品 ,去除無機碳,而后測量 TOC的濃度。現代的TOC連續分析儀中，絕大部分都是濕法氧化。濕法氧化對于復雜的水體(例如:腐殖酸、高分子量化合物等)氧化不充分,所以不適用TOC含量高的水體,但是對于常規水體如地表水、常規海水還是可以的。

高溫催化燃燒氧化的應用時間遠比濕法氧遲，但是因為高溫燃燒相對徹底,可以適用于污染較重的江河、海水以及工業廢水等水體。

其方式與濕法氧化相同，不過是采用紫外光(185nm)進行照射的原理,在樣品進入紫外反應器之前去toc總有機碳分析儀除無機碳，得到更精確的結果。紫外氧化法,對于顆粒狀有機物、藥物、蛋白質等高含量TOC是不適用的,但可以用于原水、工業用水等水體。

這種方式是紫外氧化和濕法氧化兩者協同作用,相互補充,相互促進,氧化降解效果優于其中任何一種方法。針對紫外氧化無法用于高含量TOC水體，兩者的協同可以測量污染較重的水體，但是存在裝置相對復雜 ,運行成本高的特點。